Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2E1P29083 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms