Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms