Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms