Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3KQ59H18 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms