Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 NGG1YDR176W 2109 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 ULP1YPL020C 1866 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YKL050CYKL050C 2769 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 DAP2YHR028C 2457 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RRN7YJL025W 1545 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 TRM82YDR165W 1335 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RDS2YPL133C 1341 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RPA14YDR156W 414 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 GIM4YEL003W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MRPL9YGR220C 810 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YJR020WYJR020W 333 nt3.55□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RNR1YER070W 2667 nt3.54□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 GCN5YGR252W 1320 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 NRP1YDL167C 2160 nt3.54□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 YJL114WYJL114W 681 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 GIM5YML094W 492 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 GRX7YBR014C 612 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 TOA1YOR194C 861 nt3.54□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 MRPS9YBR146W 837 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 IOC2YLR095C 2439 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 SHQ1YIL104C 1524 nt3.54□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 NOP56YLR197W 1515 nt3.54□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YGR117CYGR117C 1431 nt3.53□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 UBX3YDL091C 1368 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 AI4Q0065 1671 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 SLF1YDR515W 1344 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 GCD2YGR083C 1956 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 TVP15YDR100W 432 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RMD6YEL072W 696 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 LOC1YFR001W 615 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 ATG27YJL178C 816 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RLP7YNL002C 969 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 IMP4YNL075W 873 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YNL324WYNL324W 396 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YBR137WYBR137W 540 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RSF2YJR127C 4143 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RSC1YGR056W 2787 nt3.53□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 VPS17YOR132W 1656 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 RPO31YOR116C 4383 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 SPT16YGL207W 3108 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 GPP2YER062C 753 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 MAM1YER106W 909 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 PEA2YER149C 1263 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 TIM10YHR005C-A 282 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 GEP4YHR100C 558 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 IRC18YJL037W 675 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YJR087WYJR087W 351 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 AIM36YMR157C 768 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YNL122CYNL122C 348 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 PHO88YBR106W 567 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 SMI1YGR229C 1518 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 FMP25YLR077W 1752 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 PRM15YMR278W 1869 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 ABP140YOR239W 1887 nt3.52□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 SEC6YIL068C 2418 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 ERB1YMR049C 2424 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 PMI40YER003C 1290 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 THG1YGR024C 714 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 CFD1YIL003W 882 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YLR334CYLR334C 381 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 SEN15YMR059W 387 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 RAD14YMR201C 1116 nt3.51□□□□□ -1.85 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATP11YNL315C 957 nt3.51□□□□□ -1.85 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR022CYPR022C 3402 nt3.51□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 TSR1YDL060W 2367 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 MRPL11YDL202W 750 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YDR090CYDR090C 933 nt3.5□□□□□ -1.85 RIP-Chip
PUF2Q12221 AML1YGR001C 747 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 ECM4YKR076W 1113 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 CMS1YLR003C 876 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YHC1YLR298C 696 nt3.5□□□□□ -1.85 RIP-Chip
PUF2Q12221 TIR2YOR010C 756 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 CST9YLR394W 1449 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 CAF130YGR134W 3369 nt3.5□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 TFB2YPL122C 1542 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 ALA1YOR335C 2877 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 OSH3YHR073W 2991 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 RPS8BYER102W 603 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YGR114CYGR114C 390 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 SOP4YJL192C 705 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 RPS8AYBL072C 603 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 TSR4YOL022C 1227 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YPL035CYPL035C 348 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 KAR4YCL055W 1008 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 IMD4YML056C 1575 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 YOL019WYOL019W 1656 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 GPI1YGR216C 1830 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 ISM1YPL040C 3009 nt3.49□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 ESA1YOR244W 1338 nt3.48□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 PMT6YGR199W 2280 nt3.48□□□□□ -1.85
PUF2Q12221 LRS4YDR439W 1044 nt3.48□□□□□ -1.85
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