Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKI67P46013 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKI67P46013 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKI67P46013 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKI67P46013 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKI67P46013 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKI67P46013 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKI67P46013 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKI67P46013 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKI67P46013 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKI67P46013 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKI67P46013 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKI67P46013 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms