Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms