Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms