Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms