Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms