Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms