Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EEA1Q15075 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
EEA1Q15075 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms