Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT72Q14CN4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT72Q14CN4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms