Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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