Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS1P54277 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS1P54277 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS1P54277 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS1P54277 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS1P54277 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS1P54277 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS1P54277 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS1P54277 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS1P54277 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS1P54277 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMS1P54277 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMS1P54277 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS1P54277 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS1P54277 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms