Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP69A5D8W1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP69A5D8W1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP69A5D8W1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP69A5D8W1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms