Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEFF2Q9UIK5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms