Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPG2Q9UBF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms