Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DPM3Q9P2X0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms