Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIRT1Q96EB6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms