Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms