Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP30Q70CQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms