Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms