Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms