Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPO2Q5TGU0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms