Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms