Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME3Q16798 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME3Q16798 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME3Q16798 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME3Q16798 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME3Q16798 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME3Q16798 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ME3Q16798 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME3Q16798 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME3Q16798 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ME3Q16798 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME3Q16798 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME3Q16798 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME3Q16798 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
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