Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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