Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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COL19A1Q14993 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL19A1Q14993 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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