Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 COX13YGL191W 390 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RSR1YGR152C 819 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 FUR1YHR128W 651 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 DPH1YIL103W 1278 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 ENT3YJR125C 1227 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 ENV10YLR065C 546 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 CDC123YLR215C 1083 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 MRPL3YMR024W 1173 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SAP30YMR263W 606 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SHG1YBR258C 429 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YGR117CYGR117C 1431 nt5.4□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RRN7YJL025W 1545 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MCX1YBR227C 1563 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YER034WYER034W 558 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 BNA6YFR047C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 EMC2YJR088C 879 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MTW1YAL034W-A 870 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 GCY1YOR120W 939 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 GLT1YDL171C 6438 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 DIT2YDR402C 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 TSR1YDL060W 2367 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RSC58YLR033W 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 HDA2YDR295C 2025 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YCR064CYCR064C 411 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 IES5YER092W 378 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 PRM8YGL053W 714 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 OAR1YKL055C 837 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 POP3YNL282W 588 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MBA1YBR185C 837 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 VPS9YML097C 1356 nt5.38□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YEH2YLR020C 1617 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 FAP1YNL023C 2898 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 BNA7YDR428C 786 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YER119C-AYER119C-A 372 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YKT6YKL196C 603 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 NNT1YLR285W 786 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YBL010CYBL010C 843 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 DDP1YOR163W 567 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 SPN1YPR133C 1233 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 PSP1YDR505C 2526 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 HXT14YNL318C 1623 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MDM36YPR083W 1740 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RFA1YAR007C 1866 nt5.37□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 UBA2YDR390C 1911 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MIP6YHR015W 1980 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 CWC2YDL209C 1020 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 ASG7YJL170C 630 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 ARC18YLR370C 537 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 PBI2YNL015W 228 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MDG1YNL173C 1101 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RHO5YNL180C 996 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 IST1YNL265C 897 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 HUB1YNR032C-A 222 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 GAL80YML051W 1308 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 SNU56YDR240C 1479 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RPN3YER021W 1572 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MSE1YOL033W 1611 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 EXO1YOR033C 2109 nt5.36□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 DNF2YDR093W 4839 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 NAT1YDL040C 2565 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 GRS1YBR121C 2004 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 NHX1YDR456W 1902 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 ASI1YMR119W 1875 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 PEX29YDR479C 1665 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 UBP16YPL072W 1500 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 TRM11YOL124C 1302 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RPS4AYJR145C 786 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 IDP2YLR174W 1239 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 ASI2YNL159C 870 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 ATG3YNR007C 933 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 VAM10YOR068C 345 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 OM14YBR230C 405 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 IMH1YLR309C 2736 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RET1YOR207C 3450 nt5.35□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RRN11YML043C 1524 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 HNT1YDL125C 477 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YGL108CYGL108C 423 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 ECT1YGR007W 972 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RPA12YJR063W 378 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 CSE4YKL049C 690 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 SKO1YNL167C 1944 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 RAD54YGL163C 2697 nt5.34□□□□□ -1.55
SUB2Q07478 MDM30YLR368W 1797 nt5.34□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 SLK19YOR195W 2466 nt5.34□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 POL1YNL102W 4407 nt5.34□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 RDH54YBR073W 2877 nt5.34□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YFL015CYFL015C 495 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YLR224WYLR224W 1110 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 TOM22YNL131W 459 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 INO4YOL108C 456 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YOR029WYOR029W 336 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 YPL107WYPL107W 747 nt5.33□□□□□ -1.56
SUB2Q07478 ECM33YBR078W 1290 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 895.2 ms