Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP1P59025 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP1P59025 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP1P59025 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP1P59025 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP1P59025 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP1P59025 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP1P59025 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms