Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM33P57088 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM33P57088 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms