Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA4P43358 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms