Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YBR089W	YBR089W	600 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	BEM4	YPL161C	1902 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PLM2	YDR501W	1566 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	BMT5	YIL096C	1011 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	ATG27	YJL178C	816 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YNL035C	YNL035C	1170 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RPL33A	YPL143W	324 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YPR078C	YPR078C	1119 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	CEP3	YMR168C	1827 nt		2.88	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PIN4	YBL051C	2007 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	snR70	snR70	164 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	STE14	YDR410C	720 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	LRS4	YDR439W	1044 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	AST2	YER101C	1293 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	SPT2	YER161C	1002 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	LIF1	YGL090W	1266 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YAR075W	YAR075W	474 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	CPR8	YNR028W	927 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PFK27	YOL136C	1194 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	HHF1	YBR009C	312 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	MYO5	YMR109W	3660 nt		2.87	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	SQS1	YNL224C	2304 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	AIM6	YDL237W	1173 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PEF1	YGR058W	1008 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	IMP3	YHR148W	552 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	SED5	YLR026C	1023 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YMR178W	YMR178W	825 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RPC34	YNR003C	954 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	TAF3	YPL011C	1062 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	HUL5	YGL141W	2733 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YJR061W	YJR061W	2808 nt		2.86	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YLR278C	YLR278C	4026 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	IZH1	YDR492W	951 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	EPT1	YHR123W	1176 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YJR020W	YJR020W	333 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RUF20	RUF20	443 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	snR11	snR11	258 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YPR142C	YPR142C	564 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YBR116C	YBR116C	528 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RPN4	YDL020C	1596 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YML096W	YML096W	1578 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	FAS1	YKL182W	6156 nt		2.85	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PEX10	YDR265W	1014 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PMI40	YER003C	1290 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	PCL7	YIL050W	858 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	FIP1	YJR093C	984 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	TFA2	YKR062W	987 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YML037C	YML037C	1023 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YHR078W	YHR078W	1659 nt		2.84	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	ITT1	YML068W	1395 nt		2.84	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	VIP1	YLR410W	3441 nt		2.84	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.84	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YAK1	YJL141C	2424 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	EMC2	YJR088C	879 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	LAC1	YKL008C	1257 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YLL047W	YLL047W	384 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YLR042C	YLR042C	486 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	MCA1	YOR197W	1299 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SUT2	YPR009W	807 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	HBT1	YDL223C	3141 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	NDC80	YIL144W	2076 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	DOA4	YDR069C	2781 nt		2.83	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	CET1	YPL228W	1650 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	CHS3	YBR023C	3498 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	ISC10	YER180C	804 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	MPC1	YGL080W	393 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RPS23A	YGR118W	438 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YGR190C	YGR190C	366 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YKR033C	YKR033C	426 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RDN58-2	RDN58-2	158 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	VAM10	YOR068C	345 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RPS23B	YPR132W	438 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	MRPL27	YBR282W	441 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	STE24	YJR117W	1362 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YLR001C	YLR001C	2589 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	MSM1	YGR171C	1728 nt		2.82	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	REG1	YDR028C	3045 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RIM1	YCR028C-A	408 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SMT3	YDR510W	306 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	GRX2	YDR513W	432 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RPL1B	YGL135W	654 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YIR040C	YIR040C	333 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SNX4	YJL036W	1272 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	OMA1	YKR087C	1038 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	POP8	YBL018C	402 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RPL13B	YMR142C	600 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YOL166C	YOL166C	339 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	IRC14	YOR135C	342 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	FIG1	YBR040W	897 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RPL1A	YPL220W	654 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	ERG9	YHR190W	1335 nt		2.81	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.81	□□□□□ -1.96

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