Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PABPC1P11940 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PABPC1P11940 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms