Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40AO75400 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms