Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 413.89□□□□□ -0.197e-7■□□□□ 9.7
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SF3B4Q15427 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-226ENST00000569803 539 ntTSL 513.07□□□□□ -0.327e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-220ENST00000567884 572 ntTSL 512.79□□□□□ -0.367e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-218ENST00000567243 550 ntTSL 511.99□□□□□ -0.497e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.58□□□□□ -21e-323■□□□□ 9.7
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SF3B4Q15427 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.514e-9■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ASXL1-209ENST00000555564 658 ntTSL 48.51□□□□□ -1.054e-9■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 TIMP1-203ENST00000441738 341 ntTSL 57.3□□□□□ -1.244e-9■□□□□ 9.7
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SF3B4Q15427 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.024e-7■□□□□ 9.7
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SF3B4Q15427 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-8■□□□□ 9.6
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SF3B4Q15427 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 09e-9■□□□□ 9.6
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SF3B4Q15427 LGALS3BP-204ENST00000586720 1736 ntTSL 514.55□□□□□ -0.088e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.18e-7■□□□□ 9.6
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SF3B4Q15427 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.29e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CSNK1G2-207ENST00000590106 1006 ntTSL 513.75□□□□□ -0.218e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.235e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CSNK1G2-203ENST00000585959 704 ntTSL 213.57□□□□□ -0.248e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.298e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-214ENST00000589527 818 ntTSL 312.95□□□□□ -0.348e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LTB4R-204ENST00000553481 431 ntTSL 212.61□□□□□ -0.399e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CLDN15-204ENST00000414035 632 ntTSL 512.51□□□□□ -0.419e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 WDR81-208ENST00000464528 4432 ntTSL 212.48□□□□□ -0.419e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-208ENST00000588198 1132 ntTSL 212.48□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.429e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-216ENST00000589906 540 ntTSL 312.19□□□□□ -0.468e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LGALS3BP-203ENST00000586300 442 ntTSL 212.09□□□□□ -0.478e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.649e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PSMD11-211ENST00000585265 670 ntTSL 210.5□□□□□ -0.738e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ACP1-204ENST00000405364 414 ntTSL 510.39□□□□□ -0.758e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CLDN15-203ENST00000412417 691 ntTSL 510.28□□□□□ -0.769e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.778e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ACP1-211ENST00000480874 732 ntTSL 29.5□□□□□ -0.898e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.025e-9■□□□□ 9.6
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