RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468223.1

SETD6-210, Transcript of SET domain containing 6, humanhuman

TSL 4

Gene SETD6, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD6-210ENST00000468223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.48■■■■■ 8.07
SETD6-210ENST00000468223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.54■■■■■ 6.96
SETD6-210ENST00000468223 ABCC9O60706 1549 aa57.22■■■■■ 6.75
SETD6-210ENST00000468223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.11■■■■■ 6.41
SETD6-210ENST00000468223 NACADO15069 1562 aa54.98■■■■■ 6.39
SETD6-210ENST00000468223 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.61■■■■■ 6.33
SETD6-210ENST00000468223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.53■■■■■ 6.32
SETD6-210ENST00000468223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.52■■■■■ 6.32
SETD6-210ENST00000468223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.27■■■■■ 6.28
SETD6-210ENST00000468223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.97■■■■■ 6.23
SETD6-210ENST00000468223 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.4■■■■■ 6.14
SETD6-210ENST00000468223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.28■■■■■ 6.12
SETD6-210ENST00000468223 SCRIBQ14160 1630 aa53.2■■■■■ 6.11
SETD6-210ENST00000468223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.96■■■■■ 6.07
SETD6-210ENST00000468223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.58■■■■■ 6.01
SETD6-210ENST00000468223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.03■■■■■ 5.92
SETD6-210ENST00000468223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.86■■■■■ 5.89
SETD6-210ENST00000468223 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.49■■■■■ 5.83
SETD6-210ENST00000468223 SMARCA4P51532 1647 aa50.93■■■■■ 5.74
SETD6-210ENST00000468223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.83■■■■■ 5.73
SETD6-210ENST00000468223 SMARCA2P51531 1590 aa50.65■■■■■ 5.7
SETD6-210ENST00000468223 NCAPD3P42695 1498 aa50.65■■■■■ 5.7
SETD6-210ENST00000468223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.62■■■■■ 5.69
SETD6-210ENST00000468223 HMGXB3Q12766 1538 aa50.5■■■■■ 5.67
SETD6-210ENST00000468223 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.47■■■■■ 5.67
SETD6-210ENST00000468223 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.41■■■■■ 5.66
SETD6-210ENST00000468223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.22■■■■■ 5.63
SETD6-210ENST00000468223 WIZO95785 1651 aa49.91■■■■■ 5.58
SETD6-210ENST00000468223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.71■■■■■ 5.55
SETD6-210ENST00000468223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.46■■■■■ 5.51
SETD6-210ENST00000468223 NESP48681 1621 aa49.44■■■■■ 5.5
SETD6-210ENST00000468223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
SETD6-210ENST00000468223 ERCC6Q03468 1493 aa49.4■■■■■ 5.5
SETD6-210ENST00000468223 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.11■■■■■ 5.45
SETD6-210ENST00000468223 CUX2O14529 1486 aa49.06■■■■■ 5.44
SETD6-210ENST00000468223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.04■■■■■ 5.44
SETD6-210ENST00000468223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.03■■■■■ 5.44
SETD6-210ENST00000468223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
SETD6-210ENST00000468223 CFTRP13569 1480 aa48.82■■■■■ 5.41
SETD6-210ENST00000468223 PRDM2Q13029 1718 aa48.72■■■■■ 5.39
SETD6-210ENST00000468223 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.7■■■■■ 5.39
SETD6-210ENST00000468223 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.6■■■■■ 5.37
SETD6-210ENST00000468223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.59■■■■■ 5.37
SETD6-210ENST00000468223 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.57■■■■■ 5.37
SETD6-210ENST00000468223 WDR62O43379 1518 aa48.47■■■■■ 5.35
SETD6-210ENST00000468223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
SETD6-210ENST00000468223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
SETD6-210ENST00000468223 ABCC8Q09428 1581 aa47.84■■■■■ 5.25
SETD6-210ENST00000468223 TOPBP1Q92547 1522 aa47.8■■■■■ 5.24
SETD6-210ENST00000468223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.79■■■■■ 5.24
SETD6-210ENST00000468223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.66■■■■■ 5.22
SETD6-210ENST00000468223 IFT140Q96RY7 1462 aa47.58■■■■■ 5.21
SETD6-210ENST00000468223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
SETD6-210ENST00000468223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
SETD6-210ENST00000468223 CUX1P39880 1505 aa47.34■■■■■ 5.17
SETD6-210ENST00000468223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
SETD6-210ENST00000468223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
SETD6-210ENST00000468223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.21■■■■■ 5.15
SETD6-210ENST00000468223 WDR97A6NE52 1622 aa47.1■■■■■ 5.13
SETD6-210ENST00000468223 SOGA1O94964 1423 aa47.1■■■■■ 5.13
SETD6-210ENST00000468223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.08■■■■■ 5.13
SETD6-210ENST00000468223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.99■■■■■ 5.11
SETD6-210ENST00000468223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.96■■■■■ 5.114e-9■■■■■ 51.3
SETD6-210ENST00000468223 TOP2BQ02880 1626 aa46.94■■■■■ 5.11
SETD6-210ENST00000468223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.1
SETD6-210ENST00000468223 SYNJ1O43426 1573 aa46.86■■■■■ 5.09
SETD6-210ENST00000468223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
SETD6-210ENST00000468223 OSCARQ8IYS5 282 aa46.8■■■■■ 5.08
SETD6-210ENST00000468223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.78■■■■■ 5.08
SETD6-210ENST00000468223 CHD1O14646 1710 aa46.76■■■■■ 5.08
SETD6-210ENST00000468223 PBRM1Q86U86 1689 aa46.71■■■■■ 5.07
SETD6-210ENST00000468223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.68■■■■■ 5.06
SETD6-210ENST00000468223 GRIN2BQ13224 1484 aa46.66■■■■■ 5.06
SETD6-210ENST00000468223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.62■■■■■ 5.05
SETD6-210ENST00000468223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
SETD6-210ENST00000468223 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.61■■■■■ 5.05
SETD6-210ENST00000468223 SYNJ2O15056 1496 aa46.4■■■■■ 5.02
SETD6-210ENST00000468223 FBLN2P98095 1184 aa46.37■■■■■ 5.01
SETD6-210ENST00000468223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
SETD6-210ENST00000468223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.26■■■■■ 5
SETD6-210ENST00000468223 ADAMTS12P58397 1594 aa46.25■■■■■ 4.99
SETD6-210ENST00000468223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.25■■■■■ 4.99
SETD6-210ENST00000468223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.25■■■■■ 4.99
SETD6-210ENST00000468223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.25■■■■■ 4.99
SETD6-210ENST00000468223 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.18■■■■■ 4.98
SETD6-210ENST00000468223 ARHGEF11O15085 1522 aa46.17■■■■■ 4.98
SETD6-210ENST00000468223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.07■■■■■ 4.97
SETD6-210ENST00000468223 GRIN2AQ12879 1464 aa46.06■■■■■ 4.96
SETD6-210ENST00000468223 KIF27Q86VH2 1401 aa45.96■■■■■ 4.95
SETD6-210ENST00000468223 TRIM41Q8WV44 630 aa45.92■■■■■ 4.94
SETD6-210ENST00000468223 NUP160Q12769 1436 aa45.87■■■■■ 4.93
SETD6-210ENST00000468223 CUL7Q14999 1698 aa45.87■■■■■ 4.93
SETD6-210ENST00000468223 CEP170Q5SW79 1584 aa45.87■■■■■ 4.93
SETD6-210ENST00000468223 ARAP1Q96P48 1450 aa45.76■■■■■ 4.92
SETD6-210ENST00000468223 IGF1RP08069 1367 aa45.71■■■■■ 4.91
SETD6-210ENST00000468223 SHROOM2Q13796 1616 aa45.66■■■■■ 4.9
SETD6-210ENST00000468223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.58■■■■■ 4.89
SETD6-210ENST00000468223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.56■■■■■ 4.88
SETD6-210ENST00000468223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.46■■■■■ 4.87
SETD6-210ENST00000468223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.42■■■■■ 4.86
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