Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LEMD3Q9Y2U8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LEMD3Q9Y2U8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms