Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms