Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms