Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC9Q6ZRR7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC9Q6ZRR7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms