Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms