Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC93Q567U6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms