Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EEA1Q15075 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
EEA1Q15075 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
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