Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 GMC1YDR506C 1827 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 XKS1YGR194C 1803 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 ADE6YGR061C 4077 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YDR149CYDR149C 708 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 SLD5YDR489W 885 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YGL015CYGL015C 393 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 QCR10YHR001W-A 234 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 ENT3YJR125C 1227 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YAR023CYAR023C 540 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YNL089CYNL089C 477 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 PSY4YBL046W 1326 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 HIR2YOR038C 2628 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 OCT1YKL134C 2319 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 KRE6YPR159W 2163 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 CTK1YKL139W 1587 nt4.92□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF3Q07807 YCL068CYCL068C 783 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YGR073CYGR073C 372 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 MCR1YKL150W 909 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YKT6YKL196C 603 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 AHP1YLR109W 531 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 PNP1YLR209C 936 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YMR141CYMR141C 309 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 TIF11YMR260C 462 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 MRP21YBL090W 534 nt4.92□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF3Q07807 YRO2YBR054W 1035 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 TPK2YPL203W 1143 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 PAN1YIR006C 4443 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YRB30YGL164C 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 CAB3YKL088W 1716 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 SAT4YCR008W 1812 nt4.91□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF3Q07807 PMS1YNL082W 2622 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 FAD1YDL045C 921 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 RSM24YDR175C 960 nt4.91□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF3Q07807 YER135CYER135C 393 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 AAD16YFL057C 459 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 ZRT1YGL255W 1131 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YJL028WYJL028W 336 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YJR128WYJR128W 360 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 CGI121YML036W 546 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 RPL15BYMR121C 615 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YNL235CYNL235C 432 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YOR392WYOR392W 444 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YTA6YPL074W 2265 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 TSL1YML100W 3297 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YCT1YLL055W 1596 nt4.91□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF3Q07807 MDM34YGL219C 1380 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 IOC4YMR044W 1428 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 CIT1YNR001C 1440 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 ESF1YDR365C 1887 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 RFT1YBL020W 1725 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF3Q07807 YCR101CYCR101C 549 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YGL039WYGL039W 1047 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 GON7YJL184W 372 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 AIM32YML050W 936 nt4.9□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF3Q07807 JLP2YMR132C 627 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YOR186WYOR186W 435 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 BLM10YFL007W 6432 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 CAF4YKR036C 1932 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 HAP4YKL109W 1665 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 APC4YDR118W 1959 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MPS3YJL019W 2049 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 PBP4YDL053C 558 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MRH1YDR033W 963 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 SUR2YDR297W 1050 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 ARC1YGL105W 1131 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 SDL1YIL167W 633 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YKL066WYKL066W 444 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 VPS51YKR020W 495 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 DCS1YLR270W 1053 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 RPA43YOR340C 981 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 PLM2YDR501W 1566 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 RTT109YLL002W 1311 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MRH4YGL064C 1686 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YMR196WYMR196W 3267 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MSL5YLR116W 1431 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 ABF1YKL112W 2196 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MUD2YKL074C 1584 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 PGS1YCL004W 1566 nt4.88□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF3Q07807 ALG6YOR002W 1635 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 NCB2YDR397C 441 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YDR491CYDR491C 492 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YER034WYER034W 558 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 KGD1YIL125W 3045 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 TSR1YDL060W 2367 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 TAF5YBR198C 2397 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MMT1YMR177W 1533 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 PPN1YDR452W 2025 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 AEP1YMR064W 1557 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MSE1YOL033W 1611 nt4.87□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF3Q07807 YKR078WYKR078W 1758 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 SOL4YGR248W 768 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 KTR2YKR061W 1278 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF3Q07807 MRPL39YML009C 213 nt4.87□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF3Q07807 FEX1YOR390W 1128 nt4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms