Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKI67P46013 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKI67P46013 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKI67P46013 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKI67P46013 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKI67P46013 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKI67P46013 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MKI67P46013 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKI67P46013 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKI67P46013 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKI67P46013 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKI67P46013 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MKI67P46013 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKI67P46013 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKI67P46013 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKI67P46013 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKI67P46013 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKI67P46013 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms