Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms