Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5A1P25705 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms