Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ27

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ27 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQ27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PQ27 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms